LINE応対もメール蓄積数にカウントされますか？

はい、カウントされます。

ただし、メールとは違い、1スレッドに対して蓄積カウントは「1」となりますので、
同スレッド内（1顧客のLINEアカウント内）であれば、何回メッセージをやり取りしても蓄積数は
「1」でカウントされます。