フォルダを指定してメールをインポートすることはできますか？

はい、フォルダを指定してメールをインポートすることは可能です。

インポート方法は以下2通りございます。
・状態／フォルダを指定する
・振り分けルールを適用する

フォルダを指定してインポートしたい場合には、「状態／フォルダを指定する」をご選択ください。
インポートの操作手順は下記の通りです。

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■操作手順■
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[1]画面右上の歯車アイコン＞「管理設定」をクリックする
[2]タブメニュー「詳細設定」をクリックする
[3]「メールデータの入出力」をクリックする
[4]「メールデータのインポート」をクリックする
[5]「インポート方法」で「状態／フォルダを指定する」を選択し、
　　「メール状態」「フォルダ」を選択する
　　※「メール状態」で「指定なし」を選択した場合、受信メールは「対応完了」、
　　　送信メールは「送信メール」としてインポートされます。
[6]「インポート実行」をクリックする
[7]インポート完了

※インポート時のファイル容量の上限は100MBです。
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▼サポートサイト
　詳細設定「目次　6.1.メールデータのインポート」
　https://support.maildealer.jp/config/detail/