メールが自動的に保護されることはありますか？

いいえ、ありません。

メールの保護は手動で行います。
以下、設定方法でございます。

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「メール閲覧」画面の「メール状態の変更」欄の「保護する」にチェックを入れ、
「上記の状態に変更する」をクリック