はい、特定のフォルダを除いて検索する事は可能です。
下記手順をご確認下さい。
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■検索手順■
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[1] 画面上部の検索バーの右側にある[▼](詳細検索)をクリック
[2] [フォルダ]項目にて、検索対象から除外したいフォルダを選択
※表示されていない場合、「+検索条件の追加」をクリック
[3] [フォルダ]選択の右にあるプルダウンメニューで以下いずれかを選択
・「を検索対象外とする」:特定のフォルダだけの場合は選択
・「を検索対象外とする(子フォルダも含む)」:親フォルダの下にある子フォルダも検
[4] 「検索」ボタンをクリック
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