保護されたメールだけを絞り込みして検索することはできますか？

はい、可能です。

下記手順をご確認下さい。

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■検索手順■
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[1]検索バー右横の「詳細検索」を開く
[2]「その他」の項目にある「保護メール」にチェックを入れる
[3]「検索」をクリック
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上記手順で検索をすると、保護されているメールだけを特定して
検索結果を表示させることが可能です。