返信するときにFromと重複する宛先を削除することはできますか？

はい。可能です。

返信をするときに、元メールのTOやCCに返信時のFromアドレスと
同じメールアドレスが含まれていた場合、自動で判別して削除する
ことが出来ます。

設定は下記をご確認下さい。

━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
■宛先重複削除を設定する方法
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
[1] 画面右上の「管理設定」 >「 管理設定」をクリック
[2] タブメニューの「詳細設定」をクリック
[3]「メールボックスの詳細設定」をクリック
[4]「基本設定」をクリック
[5]「引用」>>「全員への返信」にて
　 「CcもしくはBccがFromと重複する場合は削除する」にチェックをつける
[6]「変更」をクリック
[7] 完了
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━