添付ファイルのみを削除することはできますか？

はい、添付ファイルのみを削除することは可能です。

添付ファイルは、メール本文閲覧画面もしくはメール電話検索画面から削除することができます。
削除方法は下記をご覧ください。
※削除したファイルは復旧できませんのでご注意ください。

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◆メール本文一覧画面から削除する場合
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[1]メール本文を開く
[2]画面下にある【添付ファイル】を確認する
[3]削除したい添付ファイルのゴミ箱アイコンをクリックする
[4]「添付ファイルを削除します。よろしいですか？」で「OK」をクリックする
[5]削除完了

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◆メール電話検索から削除する場合
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[1]「詳細検索」を開く
[2]添付ファイル欄「添付あり」にチェックを入れて検索を実行する
[3]添付ファイルを削除したいメールを選択する（チェックを入れる）
[4]「添付ファイルの操作」にて削除を実行する

上記操作にあたり、
検索結果の表示を「500件」ずつに切り替えていただくと500件ずつ一括削除が可能です。
ただし、多くの添付ファイルを一度に手動削除すると動作遅延が発生する可能性がございます。━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━

また、指定した期間を経過したメールの
添付ファイルを自動で削除することも可能です。
※添付ファイルセキュリティオプション（有料）へのお申し込みが必要です。

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◆自動で削除する場合（有料オプション）
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[1]画面右上の「管理設定≫管理設定≫詳細設定」を開く
[2]「メールボックスの詳細設定≫削除の設定」を開く
[3]「添付ファイルの自動削除期限」を設定
[4]「変更」をクリック
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オプションについてはこちらをご確認下さい。
※添付ファイルが削除されたメールには、「削除済み」として
添付ファイルの削除履歴が表示されます。

※「添付ファイルの削除」という権限が付与されていないユーザは
　添付ファイルの削除をすることができませんので、権限を付与していただくか、
　権限付与をすることができる管理者様にご相談ください。